公司聘请第三方机构进行审计检查，且审计人员的住宿、餐饮、交通等费用，公司给予实报实销直接转给审计人员，该部分支出能否税前扣除？

可以扣除。根据《企业所得税税前扣除凭证管理办法》（国家税务总局公告2018年第28号发布）第四条 税前扣除凭证在管理中遵循真实性、合法性、关联性原则。真实性是指税前扣除凭证反映的经济业务真实，且支出已经实际发生；合法性是指税前扣除凭证的形式、来源符合国家法律、法规等相关规定；关联性是指税前扣除凭证与其反映的支出相关联且有证明力。
企业发生的审计人员的住宿、餐饮、交通等费用是企业经营的合理性支出，直接报销给审计人员，该支出也满足业务真实发生，支出合法且具有关联性，因此可以税前扣除。
建议：双方签订的服务合同中最好约定被审计单位承担相应的餐饮、住宿和交通费用，作为合同义务，企业所得税税前扣除更合理。