物流公司，丢了客户要运输的货，客户给我们开了货物的销售发票，我们赔偿给客户货款，进项和赔偿款做账吗？

贵公司作为物流公司，针对客户丢失的货物，客户不应该给你们开销售发票，因为货物丢失了并不能变相认为货物卖给你们物流公司了。

所以，你们物流公司可以将发票退回给客户。物流公司就该笔赔偿款做营业外支出就可以了，入账附件：运输单据、对方发票复印件（证明货物价值）、赔偿协议、转账证明、沟通记录等。且该笔赔偿款可以在企业所得税税前扣除。